早在明、清時期,魚峰區已是柳州最大的農貿市場,1929年前,轄區內只有一些小工業,1929年2月,在雞喇建成柳州機械廠,是廣西當時最大型的機械工廠??谷諔馉庨_始后,北方大批工商業主遷來柳州,在魚峰轄區辦起一批機械修理、鑄造、汽車修理等企業,逐漸形成柳州的工業區。
2000年,魚峰區轄6個街道。
2002年6月22日,國務院批準(國函〔2002〕57號):撤銷柳州市市郊區,將原郊區的羊角山鎮的水南、駕鶴、雞喇、社灣、陽和5個村和雞喇居委會劃歸魚峰區管轄;魚峰區的潭中街道劃歸城中區管轄。
2005年7月,撤銷魚峰區羊角山鎮,新設白蓮、麒麟2個街道辦事處。
2011年1月,廣西壯族自治區政府批準同意調整柳州市魚峰區和鹿寨縣行政區劃:將鹿寨縣雒容鎮整體劃歸柳州市魚峰區管轄,此次區劃調整后,魚峰區行政區域面積擴大3倍。
2012年2月22日,廣西壯族自治區政府批準同意調整柳州市魚峰區和柳北區行政區劃,將原柳州市柳北區洛埠鎮整體劃入柳州市魚峰區管轄。
2018年5月11日,廣西壯族自治區政府批準同意柳州市魚峰區和柳江區行政區劃,將原柳州市柳江區里雍鎮、白沙鎮整體劃入柳州市魚峰區管轄。